أسسها الشيخ مشكور بن محمد الخاقاني نسبا الحولاوي مولدا ، النجفي مسكنا ومدفنا الذي غرق في الحمام الهندي في النجف عام ( 1272 ) . وبعده انتقلت المكتبة إلى أولاده وهي الشيخ حسين بن مشكور بن جواد بن الشيخ مشكور الكبير .