وان سماحة المجاهد والفيلسوف والفقيه الرباني الثوري آية الله الشيخ محمد تقي مصباح يزدي، قد لبى دعوة ربه، بسبب الضعف المفرط وتدهور وضعه الصحي.
وقد تم دفن جثمانه الشريف في حرم السيدة فاطمة المعصومة عليها السلام الى جانب قبر استاذه سماحة الشيخ محمد تقي بهجت (رضوان الله تعالى عليهما) بقم المقدسة.